Em qual formato o arquivo final sai por padrão?
MP3 a 128kbps por padrão, mesmo que todas as faixas carregadas sejam WAV, o Juntador de Áudio não detecta o formato pela extensão do primeiro arquivo como o Cortador de Áudio faz. Dá para trocar para WAV ou para MP3 192/320kbps antes de exportar, se precisar de mais qualidade ou de um arquivo sem perdas.
O crossfade que eu configurar vale igual em todas as transições?
Não necessariamente. O overlap real em cada junção é o menor valor entre o crossfade pedido e a duração de cada uma das duas faixas vizinhas. Um jingle de 0.4s entre blocos de 30s e 40s, com 3s de crossfade pedidos, fica limitado a 0.4s de overlap dos dois lados, porque o jingle inteiro não comporta uma sobreposição de 3s.
Juntar arquivos em taxas de amostragem diferentes perde qualidade?
A faixa de taxa mais baixa é reamostrada para cima, para a maior taxa presente entre os arquivos carregados, nunca o contrário, então nenhuma faixa perde banda por causa da junção. A reamostragem usa um filtro sinc com janela de Blackman, o mesmo tipo de filtro band-limited que evita o aliasing característico de uma conversão por interpolação linear simples.