Por que a paleta extraída de uma foto não parece um esquema de cores "harmonioso"?
Porque o algoritmo responde "quais cores dominam esta imagem em número de pixels", não "quais cores combinam bem entre si"; uma foto de pôr do sol devolve vários tons de laranja próximos, porque é o que de fato domina a imagem, não uma paleta curada por um humano.
Quantas cores essa ferramenta consegue extrair de uma imagem?
Até 16 tons por extração; o algoritmo de median cut divide caixas de pixel até atingir a quantidade pedida ou esse teto, o que vier primeiro.
Por que duas fotos parecidas geram paletas com cores levemente diferentes?
Porque a cor modal é calculada sobre uma grade de 4096 buckets (4 bits por canal): um pixel que cai um pouco além da borda de um bucket muda qual bucket é o mais frequente da caixa, e a cor final se desloca junto.
A cor de fundo transparente de um PNG entra na paleta extraída?
Não: pixels com valor de alfa abaixo de 16 são descartados antes de qualquer cálculo, então só os pixels visíveis da imagem contribuem para as cores extraídas.